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2014年临床助理医师考试生物化学复习精讲(九)

2014-08-01 16:42阅读: 来源:文都网校责任编辑:爱医培训
[导读] 随着2014年临床助理医师考试的时间越来越近,参加考试的考生们都在紧张的复习,在此为参加2014年临床助理医师考试的考生们搜集整理了临床助理医师复习资料,希望对考生们有所帮助。 第九单元遗传信息的传递 第一节DNA的生物合成 DNA生物合成有DNA**和反转

随着2014年临床助理医师考试的时间越来越近,参加考试的考生们都在紧张的复习,在此为参加2014年临床助理医师考试的考生们搜集整理了临床助理医师复习资料,希望对考生们有所帮助。

第九单元遗传信息的传递

第一节DNA的生物合成

DNA生物合成有DNA**和反转录两种方式。

DNA**是指遗传物质的传代。

**是指以母链为模板合成子链DNA的过程。

**的分子基础是碱基配对规律和DNA双螺旋结构

**的化学本质是酶促的生物细胞单核苷酸聚合。

一、**基本规律

1.半保留**:

DNA合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整的接受过来,另一股单链则完全重新合成,这种**方式为半保留**。

2.半不连续**:

DNA**时,两条子链合成的情况不同,一条链连续合成,另一条链不连续合成。

以**叉向前移动的方向为标准,一条模板链是5’到3’走向,在其上DNA能连续合成;另一条链模板链是3’到5’走向,在其上DNA也是5’到3’方向合成,但与**叉方向正好相反,所以随着**叉的移动,形成许多不连续的片段,最后连成一条完整的DNA链。因此,这种**方式为不连续**。

3.双向**:

**起始点:DNA**在DNA特定的位点起始,叫**起始点。

原核生物只有一个**起始点(单点**),真核生物可有多个**起始点(多点**)。

**子:**起始点到**终点形成一个**单位。

原核有一个**子,真核有多个**子,**子之间形成“眼睛”结构。

多数为定点双向**。

二、**的酶学

(一)DNA聚合的参与物

1.原料:dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)

2.模板:DNA两条链分别做模板

3.引物:小段寡核苷酸,多为RNA(提供3’-0H末端)

4.多种酶:DNA聚合酶、引物酶或RNA聚合酶、解螺旋酶、DNA拓扑异构酶、单链DNA结合蛋白

5.Mg2+

(二)DNA聚合酶(DNA依赖的DNA聚合酶、DNA-poI)

1.原核生物DNA聚合酶

(1)原核生物DNA聚合酶有三种:

DNA聚合酶I:切除引物、填补空隙,在修复合成中起主要作用

DNA聚合酶Ⅲ:在**中起主要作用的聚合酶

(2)用蛋白水解酶将DNApoII部分水解可得两个片段:

大片段(Klenow片段),75kD,活性:5’--3’聚合活性、3’--5’外切活性;

小片段,36kD,活性:5’--3’外切活性。

2.真核生物DNA聚合酶

(1)真核生物**延长中起主要催化作用的是DNA聚合酶δ。

(2)真核生物**中起校读、修复和填补引物缺口作用的聚合酶是DNA聚合酶ε。

3.DNA聚合酶的反应特点

(1)以4种dNTP为底物;

(2)反应需要接受模板的指导,不能催化游离的dNTP的聚合;

(3)反应需有引物3’-0H存在;

(4)链延长方向5’-3’;

(5)产物DNA的性质与模板相同。

(6)有校正纠错的功能

(三)引物酶或RNA聚合酶

细胞内,DNA的**需要引物(DNA或RNA),引物酶或RNA聚合酶可合成6~10个碱基的RNA引物。

(四)解螺旋酶

大肠杆菌的解螺旋酶利用ATP供能,使DNA双链解开成两条单链。

(五)DNA拓扑异构酶

1.拓扑异构酶功能

松解超螺旋、防止打结。

2.拓扑异构酶分类:

拓扑异构酶I和Ⅱ,广泛存在于原核生物和真核生物。

(1)拓扑异构酶I:使DNA的一条链发生断裂和再连接,反应无须供给能量,主要集中在活性转录区,与转录有关。

(2)拓扑异构酶Ⅱ:使DNA的两条链同时断裂和再连接,当它引入超螺旋时需要由ATP供给能量。

(六)单链DNA结合蛋白

**叉上的解螺旋酶,沿双链DNA前进,产生单链区,大量的单链DNA结合蛋白与单链区结合,阻止重新生成双链和保护单链DNA不被核酸酶降解。即**中维持模板的单链状态并保护单链的完整。

(七)DNA连接酶

通过形成磷酸二酯键,连接在互补基础上的双链DNA上的切口。

三、DNA生物合成过程

(一)起始阶段

1.螺旋松弛与解链

DNA解旋、解链、形成**叉

参与酶:拓扑异构酶、解链酶(解螺旋酶)、单链结合蛋白(SSB)

2.引发(合成RNA引物)

**起始点:DNA**在DNA特定的位点起始,叫**起始点。原核生物只有一个**起始点,真核生物可有多个**起始点。

(1)**叉在**DNA双螺旋分子的分叉处。

(2)引物酶按着单链碱基互补合成RNA引物。

原核生物**时的RNA引物较长,真核生物的引物较短。

(3)引发体将与**有关的基因命名为Dna,

DnaB是解旋酶,DnaG是引物酶。

DnaA,DnaB,DnaC,DnaG和其他一些**因子组成聚合体,再和DNA结合组成引发体。除去DnaG的聚合物叫引发前体,前体可反复和引物酶结合,合成引物。

(二)链延长

**需同时满足两条链反向平行、新链从5’→3’延长、边解链边**。

**的延长指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上,即按碱基互补原则新链不断的延长。

1.新合成链的延长方向:5’端→3’端。

2.碱基配对双链反向平行:A—T,T—A,G—C,C—G。

3.半不连续**:先导链(领头链)连续合成、随从链分段合成。(写字板)

**时两条链分别作模板,但方向相反。

新链合成方向与母链解链方向相同—连续合成—领头链

新链合成方向与母链解链方向相反—不连续合成—随从链,合成冈崎片段。

4.冈崎片段:**中不连续片段被命名为冈崎片段。随从链中的DNA片段。

原核生物的冈崎片段较长,真核生物的冈崎片段较短。

(三)终止

1.原核生物

是环状DNA,单**子**。从起始点开始进行双向**各进行1800,同时在终止点上汇合。

去除引物,填补空隙,连接冈崎片段形成完整DNA分子

2.真核生物

(1)染色体线性DNA分子末端有端粒结构,需端粒酶完成终止。

(2)端粒酶:由RNA和蛋白质组成,RNA作为模板,蛋白组分催化末端DNA合成,故端粒酶实质上属于一种特殊的反转录酶。

四、反转录(逆转录)

反转录是指以RNA为模板,即按照RNA中的核苷酸顺序合成DNA的过程。

这与通常转录过程中遗传信息流从DNA到RNA的方向相反。

(一)反转录病毒和反转录酶

1.RNA病毒的基因组是RNA而不是DNA,其**方式是反转录,也称反转录病毒。

2.反转录的信息流动方向:RNA--DNA

3.反转录酶活性:

RNA依赖的DNA聚合酶活性、DNA依赖的DNA聚合酶活性、RNA水解酶活性。

4.反应体系:

RNA模板、原料(dNTP)、引物(tRNA)、反转录酶。

(二)意义

补充中心法则;

揭示了反转录病毒的致癌机制;

为基因工程提供工具和思路。

第二节RNA的生物合成

一、RNA的生物合成(转录)的概念

转录是以DNA的一条链为模板,4种NTP为原料,在DNA指导的RNA聚合酶(DDRP)作用下,按碱基配对规律生成RNA链。

二、转录体系的组成及转录过程

(一)转录体系的组成

1.原料、RNA聚合酶及其他蛋白因子。

2.转录模板

转录是以DNA的一条链为模板。

(1)模板链(Watson链):是双链DNA中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一股单链。

(2)编码链(Crick链):与模板链互补的单链,其碱基序列与mRNA基本相同(只有T和u的差别)。

转录的碱基互补规律:A-U、T-A、C-G

(3)不对称转录:

在DNA分子双链上,一股链用作模板指引转录,而另一股链不转录;

模板链并不总是在同一单链上。

原核生物的RNA聚合酶可被利福平抑制

(2)真核生物RNA聚合酶

有多种,不同RNA由不同聚合酶催化生成。

1)RNA聚合酶I………………转录生成rRNA

2)RNA聚合酶Ⅱ………………转录生成mRNA前体

3)RNA聚合酶Ⅲ………………转录生成小分子RNA(tRNA,5SrRNA,snRNA等)

3.模板与酶的辨认结合:

原核生物以RNA聚合酶全酶结合到DNA的启动子上来启动转录,其中由σ亚基辨认启动子,其他亚基相互配合。

(二)转录过程

转录过程包括起始、延长、终止。

原核生物和真核生物的RNA-pol种类不同,结合模板的特性不一样,转录起始过程有较大区别。

1.起始

(1)s因子辨认转录起始点,RNA聚合酶与模板结合

转录起始部位也称启动子。

启动子是在转录起始点上游的特殊碱基序列,一般包括RNA聚合酶识别、结合、起始转录的特殊序列,如TATA盒。

原核生物启动子
 

原核生物转录起始复合物RNA-pol(α2ββ’σ)-DNA-pppGpN-OH3’

(2)DNA双链解开,按碱基互补掺入核苷酸

第一个磷酸二酯键生成,s亚基脱落。

(3)真核生物转录起始前复合物(PIC):

真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化,转录起始时,RNA-pol不直接结合模板,需要先和转录因子结合。

转录因子TFⅡD的TBP亚基结合TATA,在TFⅡA和ⅡB的促进和配合下,形成ⅡD-ⅡA-ⅡB-DNA复合体。TFⅡF结合RNA-polⅡ进入启动子的核心区TATA,、接着TFⅡE和TFⅡF进入而完成PIC的装配。

2.链延长

链延长方向:5’端--3’端

RNA聚合酶在模板链的移动方向:3’端--5’端

碱基配对:A—U,T—A,G—C,C—G

(1)原核生物

σ因子从全酶上脱离,余下的核心酶继续沿DNA链移动,按照碱基互补原则,不断聚合RNA。

1)酶和DNA结合较松,向前滑动,按与模板碱基配对不断合成RNA。

2)转录泡:RNA聚合酶所在区,有17个碱基对解链,有12个碱基对形成DNA-RNA杂交链,前后DNA都是双链。

3)RNA聚合酶核心酶、DNA和RNA组成的复合物,也叫转录复合物。

4)为多顺反子转录(1个启动子,数个结构基因)。

5)转录后一般不需特别加工。

(2)真核生物

1)真核生物RNA聚合酶不能直接与DNA结合,需与TFⅡD等因子结合形成复合物。

2)为单顺反子转录(1个启动子,1个结构基因)。

3)转录后需加工。

3.终止

(1)原核生物

1)依赖ρ因子(终止因子)的转录终止:ρ因子与转录产物结合,结合后ρ因子和RNA聚合酶发生构象改变,从而使RNA聚合酶停顿。

2)非依赖ρ因子的转录终止:转录产物的3’端有多个连续的u,在连续u的5’上游可形成发夹结构。

(2)真核生物mRNA在修饰点处被切断。

转录终止的修饰点:读码框架下游的AATAAA序列,及再下游有相当多的GT序列。

三、真核生物转录后修饰

转录生成的RNA是初级转录产物。真核生物mRNA转录后,需进行首尾修饰,以及对mRNA链进行剪接。

mRNA的转录后加工

1.首、尾的修饰

“戴帽”:5’端添加mGpppG一结构。

“加尾”:3’端添加多聚腺苷酸(polyA)结构。

2.剪接去除“内含子”和连接“外显子”

(1)内含子:隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。

(2)外显子:在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。

3.化学修饰甲基化等。

4.RNA编辑:是遗传信息在转录水平发生改变,由一个基因产生不止一种蛋白质。

第三节蛋白质生物合成

一、蛋白质的生物合成体系

反应体系:

原料:20种氨基酸

模板:mRNA

场所:核糖体

氨基酸的“搬运工具”:tRNA

酶与蛋白质因子:氨基酰tRNA合成酶、转肽酶

起始因子、延长因子、终止因子

能量:ATP、GTP

无机离子:K+、Mg2+

(一)翻译模板mRNA及遗传密码

1.mRNA是遗传信息的携带者,是蛋白质合成的直接模板。

基本概念:

(1)顺反子:遗传学将编码一个多肽的遗**位称顺反子。

(2)多顺反子:原核细胞中数个结构基因常串连为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质。转录后一般不需特别加工。

(3)单顺反子:真核结构基因的遗传信息是不连续的,mRNA转录后需要加工,成熟才成为翻译的模板,一个mRNA只编码一种蛋白质。

2.mRNA上存在遗传密码。

(1)概念:

密码子:mRNA中每3个核苷酸组成一组,代表相应的氨基酸或翻译起始、终止信号。

起始密码:5’端AUG,编码甲酰甲硫氨酸(细菌)或甲硫氨酸(高等动物)。

终止密码:UAA,UAG或UGA(不编码相应的氨基酸)。

(2)密码数量:64个,表示氨基酸的密码有61个。

(3)遗传密码的特点

①连续性:

编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。

②简并性:

多个密码可编码同一种氨基酸,即一种氨基酸可由多个密码表示

编码同一种氨基酸的多个密码称同义密码。

其原因是由于密码子与反密码子之间存在不稳定配对(摆动性或摇摆性)。

③通用性:

蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。

④摆动性

反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。

主要发生在密码子的第3位(3’端)与反密码子的第1位之间(5’端)。

tRNA反密码子第一个核苷酸(5’端)与mRNA密码子的第三个核苷酸(3’端)配对时,除A—U、G—C外,还可有U—G、I—C、I—A、I—U等。

(二)核糖体是多肽链合成的装置

1.构成

(1)原核生物中的核糖体大小为70S,可分为30S小亚基和50S大亚基。由16SrRNA,5SrRNA,23SrRNA和蛋白质组成。

(2)真核生物中的核糖体大小为80S,也分为40S小亚基和60S大亚基。由18SrRNA,5SrRNA,28SrRNA,5.8SrRNA和蛋白质组成。

2.功能

核糖体的大、小亚基分别有不同的功能。

(1)小亚基可与mRNA、GTP和起始氨基酰tRNA结合。

(2)大亚基具有转肽酶活性;具有两个不同的tRNA结合点

A位——受位或氨酰基位,可与新进入的氨基酰tRNA结合;

P位——各位或肽酰基位,可与延伸中的肽酰基tRNA结合。

(三)tRNA与氨基酸的活化

tRNA在蛋白质合成中携带氨基酸并保证氨基酸准确就位。

一种tRNA可携带一种氨基酸;而一种氨基酸可有数种tRNA携带,参与蛋白质的合成。

1.氨基酸的活化:氨基酸的羧基与特异tRNA结合形成氨基酰一tRNA,连接位置是tRNA的3’-C-C-A-OH,此过程由氨基酰一tRNA合成酶(特异识别氨基酸、tRNA)催化。

2.起始肽链合成的氨基酰一tRNA

原核生物:起始密码只能辨认甲酰化的甲硫氨酸。

真核生物:与甲硫氨酸结合的tRNA至少有两种。

3.通过密码和反密码的不稳定配对使氨基酸运到准确的位置。

(四)蛋白质因子

包括启动因子、延长因子、终止因子。

二、蛋白质生物合成过程

翻译过程从阅读框架的5’一AUG开始,按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码出现。整个翻译过程可分为起始,延长,终止。

(一)肽链的合成起始

指mRNA和起始氨基酰一tRNA分别与核糖体结合而形成翻译起始复合物。

该过程需要多种起始因子和GTP参加。(参与该过程的多种蛋白质因子称为起始因子)

1.原核生物翻译起始复合物形成

(1)核糖体大小亚基分离。

(2)mRNA在小亚基就位。

S—D序列AGGA与16S—rRNA3’端UCCU互补。

S—D序列:原核生物mRNA起始密码AUG上游约8—13个核苷酸部位,存在4—9个核苷酸的一致序列,富含嘌呤碱基,如一AGGAGG一,为核糖体结合位点。

(3)起始氨基酰一tRNA的结合(甲酰蛋氨酰-tRNA)。

(4)核糖体大亚基结合。

2.真核生物翻译起始复合物形成

(1)核糖体大小亚基分离。

(2)起始氨基酰一tRNA与小亚基结合(蛋氨酰tRNA)。

(3)mRNA在**白体小亚基就位。

(4)核糖体大亚基结合。

(二)肽链的延长

根据mRNA密码序列的指导,依次添加氨基酸从N端向C端延伸肽链,直到合成终止的过程。

肽链的延长也称为**白体循环。

**白体循环:肽链延长在**白体上连续性循环式进行,每次循环增加一个氨基酸,包括以下三步:进位、成肽、转位。

1.进位

指根据mRNA下一组遗传密码指导,使相应氨基酰-tRNA进入**白体A位。

该过程消耗GTP.

碱基配对除A—u、G—c外,还可有u—G、I—c、I—A、I—u等。

2.成肽

是由转肽酶催化的肽键形成过程。

肽链合成方向N端→C端。

3.移位需要消耗GTP

核糖体沿mRNA从5’→3’移动一个密码的距离

肽链长度预测:起始密码AUG到终止密码之间的密码子数目。

(三)肽链合成的终止

1.当核糖体A位出现mRNA的终止密码后,终止因子(释放因子)与其结合,多肽链合成停止。

2.转肽酶起水解作用使肽链从肽酰一tRNA中释放

3.mRNA、**白体大、小亚基等分离等分离,重新利用。

释放因子RF功能:识别终止密码和诱导转肽酶改变为酯酶活性起水解作用。

进而使合成的肽链脱落并促进mRNA与核糖体分离。

在体内合成多肽链时是多**白体循环。

多肽链合成后还需要剪切、侧链修饰、亚基聚合等加工修饰才能成为有功能的蛋白质。

三、蛋白质生物合成与医学的关系

蛋白质生物合成是很多抗生素和某些毒素的作用靶点。它们通过阻断真核、原核生物蛋白质翻译体系某组分功能,干扰和抑制蛋白质生物合成过程而起作用。

抑制剂:抗生素、干扰素、毒素。

抗生素类(表1-1-10-1)。

表1-1-10-1抑制蛋白质生物合成的抗生素类

抗生素抑制对象作用环节作用原理

氯霉素原核生物50S(大)亚基抑制转肽酶

四环素(金霉素等)原核生物30S(大)亚基阻碍AA-tRNA与小亚基结合

链霉素原核生物30S(大)亚基抑制起动,造成误译

***真核生物60S(大)亚基抑制转肽酶

嘌呤霉素(AA~tRNA类似物)原核、真核生物竞争结合A位促使肽链提前终止

四、基因表达调控

基因表达的概念.:

在一定调节机制控制下,大多数基因经历基因激活、转录及翻译等过程,产生具有特异生物学功能的蛋白质分子的过程。基因表达赋予细胞或个体一定的功能或形态表型。

即基因表达就是基因转录及翻译的过程。

【习题】

1.翻译过程是指

A.DNA→DNA

B.DNA→RNA

C.RNA→RNA

D.RNA→蛋白质

E.蛋白质→DNA

『正确答案』D

2.蛋白质生物合成不需要的物质是

A.氨基酸B.DNAC.mRNAD.**白体E.多种蛋白因子

『正确答案』B

3.关于翻译叙述正确的是

A..64个密码都可代表氨基酸

B.多肽链合成过程需要CTP参与

C.真核生物起始阶段小亚基首先与mRNA结合,

D.原核生物起起始作用的是蛋氨酰tRNA

E.每增加一个氨基酸需要进位、成肽、移位

『正确答案』E

4.蛋白质生物合成的起始密码是

A.AAAB.UAUC.GCUD.AUGE.UAA

『正确答案』D

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